Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPACA9Q96E40 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPACA9Q96E40 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPACA9Q96E40 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPACA9Q96E40 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPACA9Q96E40 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms