Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGBD4Q96DM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PGBD4Q96DM1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms