Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL29Q96CT2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL29Q96CT2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms