Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EAF2Q96CJ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EAF2Q96CJ1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms