Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUNDC1Q96C34 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUNDC1Q96C34 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms