Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLUAP1Q96AJ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLUAP1Q96AJ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms