Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYAP1Q96A49 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYAP1Q96A49 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYAP1Q96A49 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms