Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLAMF9Q96A28 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF9Q96A28 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms