Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPFIA1-219ENST00000531657 3036 ntTSL 29.42□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-205ENST00000518995 731 ntTSL 39.37□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-204ENST00000518949 843 ntTSL 39.37□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATG7-207ENST00000424071 758 ntTSL 39.35□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PITPNA-204ENST00000573056 571 ntTSL 59.33□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-203ENST00000593652 905 ntTSL 29.33□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 HAUS4-213ENST00000554446 1129 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AC099509.2-201ENST00000513926 406 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IRX3-202ENST00000558054 444 ntTSL 29.28□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SH3BP4-207ENST00000454947 500 ntTSL 49.27□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PJA2-203ENST00000511624 580 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 59.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 HAUS4-208ENST00000553859 602 ntTSL 39.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC25A15-202ENST00000417731 468 ntTSL 59.21□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SIL1-206ENST00000505353 442 ntTSL 39.2□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 59.14□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AP3M1-202ENST00000372745 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GATB-212ENST00000515564 6552 ntTSL 29.08□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 C1orf228-202ENST00000418644 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.06□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SP140L-201ENST00000243810 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-211ENST00000604886 587 ntTSL 49.04□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.979e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-207ENST00000476965 1383 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-212ENST00000611080 1265 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.979e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.989e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ESCO2-201ENST00000305188 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMIM7-213ENST00000594662 1076 ntTSL 28.92□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-213ENST00000605071 725 ntTSL 38.89□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PIBF1-207ENST00000615625 1098 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GATB-207ENST00000510720 874 ntTSL 38.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 USP28-205ENST00000537706 1900 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF512-202ENST00000379717 3417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -19e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MBNL1-208ENST00000460166 552 ntTSL 48.8□□□□□ -12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDPCP-205ENST00000409354 2122 ntTSL 28.8□□□□□ -12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AL139383.1-201ENST00000454681 892 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-217ENST00000599567 579 ntTSL 48.79□□□□□ -12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UBAC2-210ENST00000480738 1017 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-228ENST00000497883 605 ntTSL 38.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UBAC2-208ENST00000473194 861 ntTSL 1 (best)8.71□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DISP1-202ENST00000360254 1069 ntTSL 58.7□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-207ENST00000503591 565 ntTSL 58.66□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-216ENST00000605471 634 ntTSL 28.66□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF480-206ENST00000598016 559 ntTSL 48.64□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-210ENST00000604543 585 ntTSL 48.54□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 48.5□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PJA2-204ENST00000512822 444 ntTSL 38.49□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 28.48□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MOK-202ENST00000517537 837 ntTSL 38.47□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ARHGAP17-208ENST00000571575 530 ntTSL 58.47□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMYD3-212ENST00000483072 466 ntTSL 28.47□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-211ENST00000522800 635 ntTSL 38.44□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)8.42□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MTCH1-203ENST00000418541 602 ntTSL 38.4□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC9A1-202ENST00000374084 695 ntTSL 58.34□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.089e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-201ENST00000276682 2041 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 OGDH-202ENST00000419661 789 ntTSL 58.31□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF20-204ENST00000478942 586 ntTSL 38.31□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.089e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AC073342.1-201ENST00000427392 592 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DNAJB1-202ENST00000396969 1287 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DOCK1-204ENST00000484400 779 ntTSL 38.03□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SP140L-208ENST00000483728 3070 ntTSL 28.01□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.139e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 STRBP-206ENST00000478973 663 ntTSL 57.99□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EIF3H-206ENST00000519046 488 ntTSL 37.98□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GAS2-203ENST00000524701 2241 ntTSL 27.97□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-218ENST00000605775 604 ntTSL 47.93□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EBF4-207ENST00000481662 299 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 COCH-211ENST00000557065 654 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 62.8
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