Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP13Q92995 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP13Q92995 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP13Q92995 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP13Q92995 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP13Q92995 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP13Q92995 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP13Q92995 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP13Q92995 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP13Q92995 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP13Q92995 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP13Q92995 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP13Q92995 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP13Q92995 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP13Q92995 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms