Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC4Q92889 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC4Q92889 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms