Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGP1Q92546 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms