Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBLCP1Q8WVY7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBLCP1Q8WVY7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms