Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3TC2Q8TF17 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3TC2Q8TF17 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms