Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPPL3Q8TCT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPPL3Q8TCT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms