Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35BQ8NCS4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms