Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00301Q8NCQ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00301Q8NCQ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms