Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD1Q8NBU5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD1Q8NBU5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms