Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM229BQ8NBD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms