Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms