Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf163Q8N9P6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms