Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NECAB1Q8N987 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECAB1Q8N987 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms