Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSGALNACT2Q8N6G5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms