Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLFN12Q8IYM2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLFN12Q8IYM2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms