Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX07

ZFPM1, Zinc finger protein ZFPM1, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFPM1Q8IX07 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZFPM1Q8IX07 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFPM1Q8IX07 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms