Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IGDCC3Q8IVU1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGDCC3Q8IVU1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms