Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV6

TMEM173, Stimulator of interferon genes protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM173Q86WV6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM173Q86WV6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM173Q86WV6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms