Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SV2BQ7L1I2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SV2BQ7L1I2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms