Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN12Q6ZSI9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms