Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNI2Q6ZMN8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNI2Q6ZMN8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms