Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC5Q6UXY8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC5Q6UXY8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms