Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBED9Q6R2W3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZBED9Q6R2W3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms