Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD18Q6PI47 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms