Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFXN4Q6P4A7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFXN4Q6P4A7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms