Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LETMD1Q6P1Q0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms