Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms