Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms