Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NANOGP8Q6NSW7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms