Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCSD1Q6JBY9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms