Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICL7

SLC35E4, Solute carrier family 35 member E4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E4Q6ICL7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E4Q6ICL7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC35E4Q6ICL7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms