Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL2Q6F5E8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms