Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1DP3Q658K8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms