Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV11

Putative UPF0633 protein ENSP00000303136, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VV11 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VV11 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q5VV11 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q5VV11 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q5VV11 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q5VV11 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q5VV11 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VV11 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VV11 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VV11 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q5VV11 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms