Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SFMBT2Q5VUG0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFMBT2Q5VUG0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms