Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PXDC1Q5TGL8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PXDC1Q5TGL8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms