Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RSPH4AQ5TD94 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RSPH4AQ5TD94 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms