Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDLRAD1Q5T700 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms