Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBXN11Q5T124 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN11Q5T124 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms