Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPANXN4Q5MJ08 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXN4Q5MJ08 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms