Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR44Q5JSH3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms